کلیسای سنت استپانوس، در 16 کیلومتری غرب شهر جلفا و در نزدیکی رودخانه ارس، در استان آذربایجان شرقی واقع شده است. این کلیسا که به نام اولین شهید مسیحیت، سنت استپانوس، نام‌گذاری شده، دومین کلیسای مهم ارامنه در ایران پس از قره کلیسا به شمار می‌آید. ساخت این بنا به قرن نهم میلادی نسبت داده می‌شود، اما در اثر زلزله‌های متعدد آسیب‌هایی دیده و در دوره‌های مختلف، از جمله دوره صفویه، مرمت و بازسازی شده است.

معماری کلیسای سنت استپانوس ترکیبی از سبک‌های اورارتویی، ساسانی و بیزانسی است که در ساخت آن به کار رفته‌اند. این ترکیب معماری، جلوه‌ای منحصر به فرد به بنا بخشیده است. تزئینات داخلی کلیسا شامل نقاشی‌های دیواری و سنگ‌نگاره‌هایی است که داستان‌های مذهبی را به تصویر می‌کشند. یکی از ویژگی‌های برجسته این کلیسا، وجود حکاکی‌هایی از صحنه سنگسار سنت استپانوس بر دیوار جنوبی آن است. این محل علاوه بر عبادت، محل تجمع روحانیون، خوش‌نویسان، هنرمندان و فعالیت‌های فرهنگی بود و حتی یک مکتب دینی و کتابخانه نیز در آن رونق داشت.

این اثر تاریخی در سال 1341 هجری شمسی به‌عنوان اثر ملی ایران ثبت شد و در سال 1386 به‌عنوان بخشی از «مجموعه کلیساهای ارمنی ایران» در یونسکو به ثبت جهانی رسید. بازدید از آن همه‌روزه از ساعت 9 صبح تا 19 ممکن است (در فصل زمستان تا ساعت 17) و هر ساله هزاران بازدیدکننده ایرانی و خارجی، به‌ویژه در ایام نوروز و تابستان، به این مکان تاریخی سفر می‌کنند. برای دسترسی به کلیسای سنت استپانوس، می‌توان از جاده‌ای کوهستانی و زیبا به سمت غرب جلفا حرکت کرد. این مسیر از کنار رودخانه ارس می‌گذرد و تابلوهای راهنما در مسیر، جهت‌یابی را آسان می‌کنند. بهترین زمان برای بازدید از کلیسای سنت استپانوس فصول بهار و تابستان است؛ زمانی که آب‌وهوا معتدل است و جلوه‌های باغی و طبیعی اطراف کلیسا زیباتر به‌نظر می‌رسد. قرارگیری بنا در دره‌ای سرسبز با مناظری کم‌نظیر، تجربه‌ای به‌یادماندنی برای علاقه‌مندان به تاریخ و معماری رقم می‌زند.